Aenigmatarchaeum

„Candidatus Aenigmatarchaeum“^[3][1][2][4] [ursprünglich „Ca. Aenigm­archae­um“^[1][2]] ist eine monotypische Gattung ultrakleiner Archaeen, die zur mono­typischen Klasse „Ca. Aenigmatarchaeia“ [früher „Aenigmarchaea“, DSEG^[5]] im ebenfalls mono­typischen Phylum „Ca. Aenigmatarchaeota“^[6][1][2][4] [früher Can­di­date division DUSEL2^(N)] im Reich Nanobdellati (DPANN-Archaeen) gehört.^[1][2]

Sie umfasst die einzige Art „Ca. Aenigmatarchaeum subterraneum“^[5][3][1][4] [ursprünglich „Ca. Aenigmarchaeum subterraneum“^[1][2]].

Die DNA-Sequenz (MAG) SCGC AAA011-O16 wurde wie 1993 von Christian Rinke et al. beschrieben, unter Tage in der Homestake Mine (HSM) in Lead, South Dakota (USA) gefunden. Wegen ihrer Verschiedenheit von anderen Archaeen-Sequenzen wurde sie zunächst einer neuen, „Ca. Aenigmarchaeum subterraneum“ genannten Spezies in einem eigenen Phylum (Abteilung, englisch division) „Ca. Aenigmatarchaeota“ (früher als „Ca. Aenigm­archae­ota“, DSEG, deep-sea euryarchaeotal group) zu den Euryarchaeota s. l., heute Methanobacteriati) zugeordnet.^[5] Die Analysen legten dann aber eine ihrer Kleinheit entsprechende Klassifizierung als DPANN-Archaeen (heute Reich Nanobdellati nahe.^[3] Zudem erfolgte 2023 eine Korrektur des Gattungsnamens zu „Ca. Aenig­mat­archaeum“.^[6]

Zwar ist dies die bisher einzige Art des Phylums mit einem vorgeschlagenen wissenschaftlichen Namen, jedoch wurden inzwischen (Stand 4. Januar 2026) eine Reihe weiterer Gensequenzen etwa aus Abwässern von Bergwerken und in Sedimenten von Thermalquellen gefunden und als der Familie „Ca. Aenigmatarchaeaceae“ zugehörig klassifiziert.^[4][7] Sie sind obligate Symbionten von Bakterien des Stammes (Phylums) Chloroflexi^[8]

Die derzeit akzeptierte Taxonomie basiert auf der List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)^[1] und dem National Center for Biotechnology Information (NCBI),^[2] ergänzt um Einträge aus der Genome Taxonomy Database (GTDB),^[4] Stand: 5. Januar 2026:

Familie „Ca. Aenigmatarchaeaceae“ Rinke et al. 2021^(L,N,G)

• Gattung „Candidatus Aenigmatarchaeum“ corrig. Rinke et al. 2013^(L,N,G) [„Ca. Aenigmarchaeum“ Rinke et al. 2013^(L,N)]
  • Spezies „Candidatus Aenigmatarchaeum subterraneum“ corrig. Rinke et al. 2013^(L,N,G)[3]​ [„Ca. Aenigmarchaeum subterraneum“ Rinke et al. 2013^(L,N), Aenigmarchaeota archaeon SCGC AAA011-O16^(N), Candidate division DUSEL2 archaeon SCGC AAA011-O16^(N)]^[5][9]
    • Stamm SCGC AAA011-O16^(L,N,G) – Fundort: Grundwasser/Abwässer der Homestake Mine (HSM), Lead, South Dakota^[10][5][11]

• Gattung CS1-C013^(G)
  • Spezies CS1-C013 sp011773475^(G) [Candidatus Aenigmatarchaeota archaeon isolate CS1-C013^(N)]
    • Stamm CS1-C013^(N,G)
  • Spezies CS1-C013 sp017608545^(G) [Candidatus Aenigmatarchaeota archaeon isolate Meg22_1618_Bin_66^(N)]
    • Stamm Meg22_1618_Bin_66^(N,G)

• Gattung JAFGAZ01^(G)
  • Spezies JAFGAZ01 sp016933455^(G) [Candidatus Aenigmatarchaeota archaeon isolate Zod_Metabat.1000^(N)]
    • Stamm Zod_Metabat.1000^(N,G)

• Gattung JAFCDY01^(G)
  • Spezies JAFCDY01 sp017609445^(G) [Candidatus Aenigmatarchaeota archaeon isolate Meg22_810_Bin_261^(N)]
    • Stamm Meg22_810_Bin_261^(N,G)
  • Spezies JAFCDY01 sp017609445^(G) [Candidatus Aenigmatarchaeota archaeon isolate Meg22_1012_Bin_181^(N)]
    • Stamm Meg22_1012_Bin_181^(N,G)

• Gattung JAAOXY01^(G)
  • Spezies JAAOXY01 sp018221065^(G) [Candidatus Aenigmatarchaeota archaeon isolate DPANNHV_H2.bin.20^(N)]
    • Stamm DPANNHV_H2.bin.20^(N,G)

• Gattung JAHIDZ01^(G)
  • Spezies JAHIDZ01 sp018901755^(G) [Nanoarchaeota archaeon isolate KR11_S3.mb.17^(N)]
    • Stamm KR11_S3.mb.17^(N,G)
  • Spezies JAHIDZ01 sp018901755^(G) [Nanoarchaeota archaeon isolate KR11_0.1_MetaG.mb.10^(N)]
    • Stamm KR11_0.1_MetaG.mb.10^(N,G)
  • Spezies JAHIDZ01 sp028715225^(G) [Candidatus Aenigmatarchaeota archaeon isolate STD1_92^(N)]
    • Stamm STD1_92^(N,G)

• Gattung JAHIEG01^(G)
  • Spezies JAHIEG01 sp018901655^(G) [Nanoarchaeota archaeon isolate KR11_0.1_MetaG.mb.112^(N)]
    • Stamm KR11_0.1_MetaG.mb.112^(N,G)

• Gattung JAWBOD01^(G)
  • Spezies JAWBOD01 sp039000735^(G) [Candidatus Aenigmatarchaeota archaeon isolate DRTY-6_201808_bins_3^(N)]
    • Stamm DRTY-6_201808_bins_3^(N,G)
  • Spezies JAWBOD01 sp039000735^(G) [Candidatus Aenigmatarchaeota archaeon isolate HHBFW-2_201803_bins_170^(N)]
    • HHBFW-2_201803_bins_170^(N,G)

• Gattung JAGGXH01^(G)
  • Spezies JAGGXH01 sp021163145^(G) [Candidatus Aenigmatarchaeota archaeon isolate AUK147^(N)]
    • Stamm AUK147^(N,G)

• L – List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)^[1]
• N – Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI)^[2]
• G – Genome Taxonomy Database (GTDB)^[4]

Der Gattungsname Ae­nig­mat­ar­chae­um setzt sich zusammen aus altgriechisch αἴνιγμα ainigma, deutsch ‚Rätsel‘ und neulateinisch archaeum ‚Archaeon‘, Aenigmatarchaeum bezeichnet also ein rätselhaftes (schwer zu klassifizierendes) Archaeon.^[1]

Der Artnamenszusatz sub­ter­ra­ne­um ist das lateinische Adjektiv subterraneum ‚unterirdisch‘^[1] und verweist damit auf die Herkunft aus einer Bergwerksmine.

1. ↑ ^{a b c d e f g h i j k l m n o p} LPSN: Genus "Candidatus Aenigmatarchaeum" corrig. Rinke et al. 2012.
2. ↑ ^{a b c d e f g h i j k l} NCBI: "Candidatus Aenigmatarchaeum", Details: "Candidatus Aenigmatarchaeum" corrig. Rinke et al. 2013, homotypic synonym: "Candidatus Aenigmarchaeum" Rinke et al. 2013 (genus); Nucleotide: Candidatus Aenigmarchaeum subterraneum SCGC AAA011-O16, …, Candidate division DUSEL2 archaeon SCGC AAA011-O16. Graphisch: Candidatus Aenigmatarchaeum, auf Lifemap.
3. ↑ ^{a b c d} Aharon Oren, George M. Garrity, Charles T. Parker, Maria Chuvochina, Martha E. Trujillo: Lists of names of prokaryotic Candidatus taxa. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Band 70, Nr. 7, 30. Juni 2020, ISSN 1466-5034, S. 3956&#x200B:–4042; doi:10.1099/ijsem.0.003789 (englisch).
4. ↑ ^{a b c d e f} GTDB: Aenigmatarchaeum. Rohdaten: ar53_metadata.tsv.gz (Fallback).
5. ↑ ^{a b c d e} Christian Rinke, Patrick Schwientek, Alexander Sczyrba, Natalia N. Ivanova, Iain J. Anderson, Jan-Fang Cheng, Aaron Darling, Stephanie Malfatti, Brandon K. Swan, Esther A. Gies, Jeremy A. Dodsworth, Brian P. Hedlund, George Tsiamis, Stefan M. Sievert, Wen-Tso Liu: Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter. In: Nature. 499. Jahrgang, Nr. 7459, 14. Juli 2013, ISSN 1476-4687, hdl:1912/6194, S. 431–437, doi:10.1038/nature12352, bibcode:2013Natur.499..431R (englisch).  Siehe insbes. Supplementary Information (PDF; 10 MB).
6. ↑ ^{a b} Aharon Oren, Markus Göker: Candidatus List. Lists of names of prokaryotic Candidatus phyla. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Band 73, Nr. 5, 9. Mai 2023, ISSN 1466-5034, S. 005821; doi:10.1099/ijsem.0.005821 (englisch).
7. ↑ Ken Takai, Duane P. Moser, Mary DeFlaun, Tullis C. Onstott, James K. Fredrickson: Archaeal Diversity in Waters from Deep South African Gold Mines. In: Applied and Environmental Microbiology. 1. Dezember 2001, S. 5750–5760, doi:10.1128/AEM.67.21.5750-5760.2001, PMID 11722932 (englisch). 
8. ↑ Nina Dombrowski, Tom A. Williams, Jiarui Sun, Benjamin J. Woodcroft, Jun-Hoe Lee, Bui Quang Minh, Christian Rinke, Anja Spang: Undinarchaeota illuminate DPANN phylogeny and the impact of gene transfer on archaeal evolution. In: Nature Communications. Band 11, Nr. 1, 7. August 2020, S. 3939, doi:10.1038/s41467-020-17408-w, PMID 32770105 (englisch). 
9. ↑ OneZoom: Candidatus Aenigmarchaeum subterraneum.
10. ↑ Homestake Mine (South Dakota), City of Lead. Auf: GeoNames.
11. ↑ Gp0010633 §Organism Information, Joined Genome Institute, DOE Office of Science.