Acidilobus

Acidilobus ist eine Gattung von Mikroorganismen innerhalb der Gruppe der Archaeen. Die Vertreter der Gattung kommen in terrestrischen und sub-lakustrischen sauren Thermalquellen vor, z. B. an etlichen Stellen im Yellowstone-Nationalpark (u. a. am Grund des Yellowstone Lake), auf Kamtschatka und den Kurileninseln und der Datun-Vulkangruppe (in Nord-Taiwan) vor (siehe Kapitel Artenliste).

Acidilobus sp. 7A [Acidilobus sp003431325^[1]] ist Wirt (Biologie) für die epibiontische Spezies „Ca. Nanopusillus acidilobi“.^[2]

Acidilobus zählt zu der Familie Acidilobaceae in der Klasse Thermoprotei, Reich Thermoproteati (TACK-Superphylum).^[5][3] Typusart gemäß LPSN ist A. aceticus (unbekannt in der GTDB, dort ersatzweise A. saccharovorans).^[3][1]

Acidilobus aceticus (mit Referenzstamm 1904ᵀ) ist der erste gefundene Vertreter der Gattung. Der Stamm wurde, wie von Maria Prokofeva et al. im Jahr 2000 veröffentlicht, aus den sauer-heißen Quellen des Vulkans Mutnowski auf der Halbinsel Kamtschatka isoliert. Es handelt sich um einen thermoacidophilen Organismus, die anaerob auf Stärke wachsen kann. Seine Zellen sind mehr oder weniger regelmäßige Kokkenform mit einem Durchmesser von 1–2 µm. Sie sind nicht beweglich (motil); ihre Zellhülle besteht aus einer Schicht (Layer) mit Untereinheiten. A. aceticus wächst als ein Hyperthermophiler im Temperaturbereich von 60–92 °C (optimal bei 85 °C), und als ein Acidophiler in einem pH-Bereich von 2,0–6,0 (optimal bei 3,8). Die Spezies ist obligat anaerob; sie fermentiert Stärke und bildet dabei als Hauptstoffwechselprodukt Acetat. Als weitere Wachstums-Substrate wurden Hefeextrakt, Rindfleischextrakt und Sojaextrakt bestätigt.^[6]

Die derzeit akzeptierte Taxonomie basiert auf der List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)^[3] und des National Center for Biotechnology Information (NCBI).^[5]

Artenliste (Stand 23. Oktober 2025):

Gattung Acidilobus Prokofeva et al. 2000^(L,G)[6] bzw. Prokofeva et al. 2009^(N) oder Prokofeva et al. 2000 emend. Prokofeva et al. 2009^(N)[7]

• Spezies Acidilobus aceticus Prokofeva et al. 2000^(L,N)[6] (Typusart gem. LPSN^(L))
  • Stamm 1904 alias ATCC BAA-268, DSM 11585 oder JCM 11320^(L,N)
    – Fundort: Mutnowski-Vulkan, Kamtschatka^(N)

• Spezies Acidilobus saccharovorans Prokofeva et al. 2009^(L,N,G)[7] (Typusart gem. GTDB^(G))
  • Stamm 345-15^(L,N,G) alias DSM 16705 oder VKM B-2471^(L,N)
    – Fundort: Solfatarfeld in der Caldera des Uson-Vulkans

• Spezies „Acidilobus sulfurireducens“ Boyd et al. 2007^(L,N)[8]
  • Stamm 18D70^(L,N)
    – Fundort: saure, sulfat- und chloridhaltige Quellen im Hundred Springs Plain^[9] im Norris-Geysir-Becken, Yellowstone-Nationalpark, USA^(N)[8]
  • Stamm ENMS9^(N)
    – Fundort: Marine Sedimente vor Ennūr (Ennore),^[10] Indien^(N)

• Spezies Acidilobus sp000495735^(G) [(uncultured) Acidilobus sp. JCHS^(N), (uncultured) Acidilobus sp. OSP8^(N), (uncultured) Acidilobus sp. MG^(N)]
  • Stamm JCHS^(N,G)
    – Fundort: Joseph's Coat Hot Spring (JCHS_4),^[11][12] Yellowstone-Nationalpark, USA^(N)
  • Stamm RSEP6^(N,G)
    – Fundort: Yellowstone Lake, USA^(N)
  • Stamm OSP8^(N)
    – Fundort: 100 Springs Plain (OSP_8),^[9] Yellowstone-Nationalpark, USA^(N)
  • Stamm RBS.bin.4^(N,G)
    – Fundort: Red Bubbler Spring am Tantalus Creek, West-Südwest vom Rediscovered Geyser^[13] Norris-Geysir-Becken, Yellowstone-Nationalpark, USA^(N)
  • Stamm MG^(N,G)
    – Fundort: Monarch Geyser (MG_3),^[14] Yellowstone-Nationalpark, USA^(N)
  • Stamm 2016_B01_C_1^(N,G)
    – Fundort: Biofilm an einer Hydrothermalen Quelle im Yellowstone Lake, USA^(N)

• Spezies Acidilobus sp002496425^(G) [Acidilobaceae archaeon UBA162^(N)]
  • Stamm UBA162^(N,G)
    – Fundort: Thermalquelle Shi-Huang-Ping (SHP),^[15] (alias Szehuangtzeping), eine sauer-heiße Quelle der Datun-Vulkangruppe (大屯火山群, Tatun Volcanic Group, TVG), Nord-Taiwan^(N)

• Spezies Acidilobus sp003431325^(G) [„Acidilobus nanophilum“,^[2] Acidilobus sp. 7A^(N)[2]]
  • Stamm 7A^(N,G)
    – Fundort: Cistern Spring,^[16][17] Norris-Geysir-Becken, Yellowstone-Nationalpark, USA^(N)

• Spezies Acidilobus sp022015155^(G)
  • Stamm CP.2016.15m.Bin.2^(N,G)
    – Fundort: Cinder Pool, im Bogen des Tantalus Creek, westlich vom Constant Geyser.^[18] One Hundred Spring Plain, Yellowstone-Nationalpark, USA^(N)
  • Stämme CP.2020.9m.Bin.2; CP.2020.0m.Bin.2; CP.2020.15m.Bin.3; CP.2016.9m.Bin.3; CP.2016.0m.Bin.5^(N,G)
    – Fundorte: ebenfalls Cinder Pool, Yellowstone-Nationalpark, USA^(N)

• Spezies Acidilobus sp028276005^(G) [(uncultured) Acidilobus sp. CIS^(N), Acidilobus sp. isolate RSNS4^(N)]
  • Stamm RSNS4^(N,G)
    – Fundort: Sediment einer heißen Quelle im Yellowstone Lake, USA^(N)
  • Stamm EvPrim.Bin1^(N,G)
    – Fundort: Sediment vom Rand (englisch shelf) der Evening Primrose Hot Spring,^[19] Yellowstone-Nationalpark, USA
  • Stamm CIS^(N,G)
    – Fundort: Cistern Spring (CIS_19),^[16][17] Norris-Geysir-Becken, Yellowstone-Nationalpark, USA^(N)

• Spezies Acidilobus sp. 124-87^(N)
  • Stamm 124-87^(N)
    – Fundort: Pauzhet(k)a-Gebiet (russisch Паужетка Pauschetka, englisch Pauzhet(k)a oder Paujetka,^[20][21] beim Kurilensee, Kamtschatka^[22]

• Spezies Acidilobus sp. 405-16^(N)
  • Stamm 405-16^(N)
    – Fundort: Schlamm vom Grund eines heißen Sees in der Golownin-Caldera im Süden der Insel Kunaschir, Kurilen^[22]

• Spezies Acidilobus sp. 722-67^(N)
  • Stamm 722-67
    – Fundort: grau-brauner Schlamm aus einem kleinen Schlammpool im zentralen Thermalfeld der Uson-Caldera, Kamtschatka^[22]

• Spezies Acidilobus sp. SCGC AC-742_E15^(N,G)
• Spezies Acidilobus sp. SCGC AC-742_M05^(N,G)
• Spezies Acidilobus sp. SCGC AD-903-A07^(N)
• Spezies Acidilobus sp. SCGC AD-903-A15^(N)
• Spezies Acidilobus sp. SCGC AD-903-D05^(N)
• Spezies Acidilobus sp. SCGC AD-903-D17^(N)
• Spezies Acidilobus sp. SCGC AD-903-D20^(N)
• Spezies Acidilobus sp. SCGC AD-903-F06^(N)
• Spezies Acidilobus sp. SCGC AD-903-I03^(N)
• Spezies Acidilobus sp. SCGC AD-903-I23^(N)
• Spezies Acidilobus sp. SCGC AD-903-J15^(N)
• Spezies Acidilobus sp. SCGC AD-903-J18^(N)
• Spezies Acidilobus sp. SCGC AD-903-K10^(N)
• Spezies Acidilobus sp. SCGC AD-903-K18^(N)
• Spezies Acidilobus sp. SCGC AD-903-M03^(N)
• Spezies Acidilobus sp. SCGC AD-903-N04^(N)
• Spezies Acidilobus sp. SCGC AD-903-N18^(N)
• Spezies Acidilobus sp. SCGC AD-903-O15^(N)

(L) – List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)^[3]

(N) – Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI)^[5]

(G) – Genome Taxonomy Database (GTDB)^[1]

Der erstgenannte Stamm ist jeweils Referenz.

Der Gattungsname Acidilobus kommt vom lateinischen Adjektiv acidus für „sauer“ und dem latinisierten Nomen lobus „Lappen“ (von gleichbedeutend altgriechisch λοβός lobós), bezeichnet somit einen „sauren Lappen“.^[3]

• Das Art-Epitheton aceticus kommt von lateinisch acetum „Essig“; Acidilobus aceticus ist also ein „essigsaurer Lappen“.
• Das Art-Epitheton saccharovorans kommt von altgriechisch σάκχαρον sákcharon „Zucker“ und lateinisch vorans „fressend“; saccharovorans meint daher „zuckerfressend“.
• Das Art-Epitheton sulfurireducens kommt von lateinisch sulfur „Schwefel“ und reducens „reduzierend“; sulfurireducens bedeutet also „Schwefel-reduzierend“.
• Das mögliche Art-Epitheton nanophilum kommt von altgriechisch νάνος nános „Zwerg“ und latinisiert philum von altgriechisch φίλος philos „lieb, liebend, geliebt“ oder substantiviert „Freund“; die Bezeichnung unterstellt daher, dass diese Spezies einen Nutzen von ihren kleinen Nanobdellota-Epibionten haben könnte.

• Global Catalogue of Microorganisms (gcm.wfcc.info): Acidilobus aceticus (Memento vom 6. März 2016 im Internet Archive).
• Taxon: Genus Acidilobus Prokofeva et al. 2000 (prokaryote). The Taxonomicon. Universal Taxonomic Services, Zwaag, Niederlande (taxonomy.nl; Stand: 21. September 2025).

• Zack J. Jay, Doug B. Rusch, Susannah G. Tringe, C. Bailey, Ryan de M. Jennings, William P. Inskeep: Predominant Acidilobus-Like Populations from Geothermal Environments in Yellowstone National Park Exhibit Similar Metabolic Potential in Different Hypoxic Microbial Communities. In: Applied and Environmental Microbiology, Band 80, Nr. 1, 12. Dezember 2014, S. 294–305; doi:10.1128/AEM.02860-13, PMC 3911027 (freier Volltext), PMID 24162572, bibcode:2014ApEnM..80..294J (englisch).
• Siegfried Burggraf, Harald Huber, Karl O. Stetter: Reclassification of the crenarchael orders and families in accordance with 16S rRNA sequence data. In: International Journal of Systematic Bacteriology (International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology). 47. Jahrgang, Nr. 3, 1. Juli 1997, S. 657–660, doi:10.1099/00207713-47-3-657, PMID 9226896 (englisch). 
• Wolfram Zillig, Karl O. Stetter, David Prangishvilli, Werner Schafer, Simon Wunderl, Davorin Janekovic, Ingelore Holz, Peter Palm: ​Desulfurococcaceae, the second family of the extremely thermophilic, anaerobic, sulfur-respiring Thermoproteales. In: Zentralblatt für Bakteriologie Mikrobiologie und Hygiene: I. Abt. Originale C: Allgemeine, angewandte und ökologische Mikrobiologie, Band 3, Nr. 2, Mai 1982, S. 304–317; doi:10.1016/S0721-9571(82)80044-6 (englisch).

1. ↑ ^{a b c d e} GTDB: Acidilobus.
2. ↑ ^{a b c d e f} Louie Wurch, Richard J. Giannone, Bernard S. Belisle, Carolyn Swift, Sagar Utturkar, Robert L. Hettich, Anna-Louise Reysenbach, Mircea Podar: Genomics-informed isolation and characterization of a symbiotic Nanoarchaeota system from a terrestrial geothermal environment. In: Nature Communications, Band 7, Nr. 12115, 5. Juli 2016; doi:10.1038/ncomms12115, PMC 4935971 (freier Volltext), PMID 27378076, ResearchGate:304910915 (englisch).
   Anmerkung: In Fig. 5b ist augenscheinlich Acidilobus sp. 7A [≡ Acidilobus sp003431325^(G)] als „Acidilobus nanophilum“ bezeichnet.
3. ↑ ^{a b c d e f} LPSN: Genus Acidilobus Prokofeva et al. 2000.
4. ↑ SYTO™ 62 Red Fluorescent Nucleic Acid Stain - 5 mM Solution in DMSO. Auf: ThermoFisher.
5. ↑ ^{a b c} NCBI Taxonomy Browser: Acidilobus. Details: Acidilobus Prokofeva et al. 2009. Graphisch: Acidilobus. Auf: Lifemap.
6. ↑ ^{a b c} Maria I. Prokofeva, Margarita L. Miroshnichenko, Nadezhda A. Kostrikina, Nikolay A. Chernyh, B. B. Kuznetsov, Tatyana P. Tourova, Elizaveta A. Bonch-Osmolovskaya: Acidilobus aceticus gen. nov., sp. nov., a novel anaerobic thermoacidophilic archaeon from continental hot vents in Kamchatka. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 50. Jahrgang, Nr. 6, 1. November 2000, S. 2001–2008, doi:10.1099/00207713-50-6-2001, PMID 11155973 (englisch).  Digitalisat (Memento vom 17. Mai 2011 im Internet Archive; PDF, 468 kB).
7. ↑ ^{a b} Maria I. Prokofeva, Nadezhda A. Kostrikina, Tatjana V. Kolganova, Tatyana P. Tourova, A. M. Lysenko, Alexander V. Lebedinsky, Elizaveta A. Bonch-Osmolovskaya: Isolation of the anaerobic thermoacidophilic crenarchaeote Acidilobus saccharovorans sp. nov. and proposal of Acidilobales ord. nov., including Acidilobaceae fam. nov. and Caldisphaeraceae fam. nov. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Band 59, Nr. 12, 1. Dezember 2009, S. 3116–3122; doi:10.1099/ijs.0.010355-0, PMID 19643887 (englisch).
8. ↑ ^{a b} Eric S. Boyd, Robert A. Jackson, Gem Encarnacion, James A. Zahn, Trevor Beard, William D. Leavitt, Yundan Pi, Chuanlun L. Zhang, Ann Pearson, Gill G. Geesey: Isolation, Characterization, and Ecology of Sulfur-Respiring Crenarchaea Inhabiting Acid-Sulfate-Chloride-Containing Geothermal Springs in Yellowstone National Park. In: Applied and Environmental Microbiology, Band 73, Nr. 20, 15. Oktober 2007, S. 6669–6677; doi:10.1128/AEM.01321-07, PMC 2075080 (freier Volltext), PMID 17720836 (englisch).
9. ↑ ^{a b} One Hundred Spring Plain. Auf: GeoNames.
10. ↑ Ennūr. Auf: GeoNames.
11. ↑ Robert E. Stauffer, John M. Thompson: Arsenic and antimony in geothermal waters of Yellowstone National Park, Wyoming, USA. In: Geochimica et Cosmochimica Acta, Band 48, N. 12, Dezember 1984, S. 2547–2561; doi:10.1016/0016-7037(84)90305-3 (englisch).
12. ↑ Josephs Coat Springs. Auf: GeoNames.
13. ↑ Rediscovered Geyser. Auf MapCarta (de).
14. ↑ Monarch Geyser. Auf: MapCarta (de).
15. ↑ Kuei-Han Lin, Ben-Yang Liao, Hao-Wei Chang, Shiao-Wei Huang, Ting-Yan Chang, Cheng-Yu Yang, Yu-Bin Wang, Yu-Teh Kirk Lin, Yu-Wei Wu, Sen-Lin Tang, Hon-Tsen Yu: Metabolic characteristics of dominant microbes and key rare species from an acidic hot spring in Taiwan revealed by metagenomics. In. BMC Genomics, Band 16, Nr. 1029, 3. Dezember 2015; doi:10.1186/s12864-015-2230-9, PMC 4668684 (freier Volltext), PMID 26630941 (englisch).
16. ↑ ^{a b} Cistern Spring. Auf: MapCarta (de).
17. ↑ ^{a b} Cistern Spring. Auf: GeoNames.
18. ↑ Constant Geyser. Auf: GeoNames.
19. ↑ Evening Primrose Hot Spring. Auf: GeoNames.
20. ↑ Pauzhetka. Auf: GeoNames.
21. ↑ Pauzhetka, Паужетка. Auf: Mapcarta (de).
22. ↑ ^{a b c} Maria I. Prokofeva, Ilya V. Kublanov, Olivier Nercessian, Tatjana P. Tourova, Tatjana V. Kolganova, Alexander V. Lebedinsky, Elizaveta A. Bonch-Osmolovskaya, Stefan Spring, Christian Jeanthon: Cultivated anaerobic acidophilic/acidotolerant thermophiles from terrestrial and deep-sea hydrothermal habitats. In: Extremophiles, Band 9, 22. Juni 2005, S. 437–448; doi:10.1007/s00792-005-0461-4, ResearchGate:7772422, WoRMS:151650 (englisch).
23. ↑ 'The All-Species Living Tree' Project (LTP):
    • About. Abgerufen am 10. Mai 2023 (englisch). 
    • LTP_all tree im Newick-Format. Abgerufen am 10. Mai 2023. 
    • LTP_06_2022 Release Notes. Abgerufen am 10. Mai 2023 (englisch). 
24. ↑ Genome Taxonomy Database (GTDB) Release 08-RS214
    • About. In: GTDB. Abgerufen am 10. Mai 2023 (englisch). 
    • ar53_r214.sp_label (Tree File). In: Genome Taxonomy Database. Abgerufen am 10. Mai 2023. 
    • Taxon History. In: Genome Taxonomy Database. Abgerufen am 10. Mai 2023 (englisch).